El Puerto de Montevideo es el principal puerto comercial del Uruguay. Se ubica sobre el río de la Plata, en una importante zona de tránsito de cargas del Mercosur. Es un puerto natural que no necesita un periódico dragado ya que es un puerto apto para naves de gran calado. Funciona las 24 horas del día durante todo el año, en virtud de la escasa probabilidad de vientos o tormentas que impliquen el cierre de las operaciones portuarias.

El Puerto de Nueva Palmira (departamento de Colonia, Uruguay), se encuentra ubicado al inicio de la Hidrovía Paraná - Paraguay de 3.400 kilómetros que se extiende hasta Puerto Cáceres en el Mato Grosso de Brasil. Su canal de acceso es el Canal Martín García, que cuenta con un calado de 32 pies.